Роден в Озумба, щат Мексико, през 1737 г., той приема религиозна кариера и е ръкоположен за свещеник на двадесетгодишна възраст.
Въпреки философската си подготовка, от малък се занимава със знанията и приложението на природните науки, физиката, математиката и астрономията. Публикува ценни трудове по научни теми във вестниците и списанията на своето време. Той придобива международна известност и е определен за съответен партньор на Парижката академия на науките. Той прекарва голяма част от времето си в провеждане на научни експерименти и сглобява огромна библиотека. Той е колекционер на археологически парчета и редки екземпляри от растения и животни. Разгледайте Xochicalco. За да му се отдаде почит, през 1884 г. е основано Научното дружество „Антонио Алзате“, което през 1935 г. става Национална академия на науките. Най-известната му редакторска работа са бележките към древната история на Мексико от йезуита Франсиско Хавиер Клавиеро. Твърди се, че той е далечен роднина на Sor Juana Inés de la Cruz. Умира в Мексико Сити през 1799 година.
