Тъй като не знаеха докъде се простира северът на страната, йезуитите пристигнаха в Чихуахуа. През седемнадесети век сегашното състояние е конституирано в югозападната му част от това, което е било известно като региона Чинипас, докато останалата част от територията е разделена между горната и долната Тарахумара.
Първите опити за евангелизиране на Чихуахуа идват от пътуванията, извършени от йезуитите, установени преди това в щата Синалоа. Първият, построен в региона, е този, издигнат от отец Хуан Кастини през 1621 г. и известен като мисията Чинипас.
Йезуитите са работили в планините сред индианците Тепехуани, Гуазапарас и Тарахумара, докато францисканците са работили в долините и равнините. Първият стабилен мисионер в района на Чинипас беше отецът-йезуит Хулио Паскуал, мъченик през 1632 г. заедно с отец Мануел Мартинес. До 1680 г. Фрай Хуан Мария Салватиера даде енергичен импулс на мисията, която беше консолидирана през годините 1690 и 1730. В средата на XVII век йезуитските мисии в района на Чинипас станаха една от най-добре организираните и напреднали.
На юг беше Набогаме, където все още можете да видите църквата, куратора и мисионерската къща, построени от отец Мигел Вайц през 1744 г. Баборигаме Сатево се намира в същия район, който придоби нова сила с администрацията на отец Луис Мартин. и Тубарес, основана през 1699 г. от отец Мануел Ордас и възродена от администрацията на историка Феликс Себастиан. Последният е смятан за един от най-богатите в църквата, къщата, говедата и ранчотата. В центъра са мисиите на Cerocahui, Guazapares, Chínipas, Santa Ana и на север Babarocos и Moris.
Районът Tarahumara Baja е евангелизиран за първи път от отец Хуан Фонте, който прави първия си вход през 1608 г. През 1639 г. отец Jerónimo Figueroa изгражда мисията на Сан Пабло Балеза и тази на Huejotitán (San Jerónimo), докато по същото време отец Хосе Паскуал строи Сан Фелипе. В рамките на същия регион Тарахумара се намират още La joya, Санта Мария де лас Куевас и Сан Хавиер Савето, тази последна мисия, построена през 1640 г. от отец Вирджилио Маес.
По отношение на територията на Тарахумара Алта, която обхващаше центъра и на север от това образувание, евангелизационната работа започна от отци Тара, Гуадалахара, Челада, Таркай и Нойман. Мисиите, включени в този регион, бяха: Тоначи, Норогачи, Ноноава, Нарачи, Сисогуичи, Каричи, Сан Борха, Темечи или Темейчи, Коячи или Коячич, Томочи или Томочич, Тутуака или Тутуата, Папигочи, Санто Томас, Матачи и Маточи. В средата на седемнадесети век йезуитската мисия в Чихуахуа става най-добре организираната и администрирана, с изключение на тези в Калифорния.
На територията на Чихуахуан е имало и мисионерската дейност на францисканците. Целта на религиозните е била да завърши връзката, която вече е съществувала в северната част на Сакатекас, за която те основават манастири в Чихуахуа и Дуранго. Подобно на йезуитите манастирите трябваше да изпълнят целта да евангелизират неверниците. Изградените сгради бяха на Северната Дева Мария, която сега е Ciudad Juárez, San Buenaventura de Atotonilco (Villa López), Santiago Babonoyaba, Parral, Santa Isabel de Tarahumara, San Pedro de los Conchos, Bachiniva или Bacínava (Our Lady of Nativity) ), Намикипа (San Pedro Alcántara), Carretas (Santa María de Gracia), Julimes, San Andrés, Nombre de Dios, San Felipe el Real de Chihuahua и Casas Grandes.
