Лекарят и учителят Себастиан Ролдан и Малдонадо по завещание дава през 1735 г. богатството си от 26 хиляди песо за мисии на йезуитите в света на Нова Испания.
Сестра му, г-жа Анджела Ролдан, вдовица на H. (O) rdeñana, години по-късно, през 1743 г., решава да добави 50 хиляди песо към наследството на брат си за същата цел. След това началниците решиха да придобият в Пуебла земята в непосредствена близост до Плаза де Гуадалупе, за да построят църквата и училището в Сан Франциско Хавиер, последната важна работа на Обществото на Исус в този град и в Мексико преди експулсирането им.
Между 1 и 13 декември 1751 г. се провежда откриването на църквата и училището, като подобно на Сан Грегорио де Мексико, за да предаде християнска доктрина и първи писма сред местните жители, да извършва мисионерска дейност в кварталите на Ангелополис и в Сиера де Пуебла, както и за обучение на йезуити на естествени езици. В ранните си години той е имал повече от 200 ученици.
Там той работи като индийски работник от 1761 г., според записите, най-известната от личностите на своето време: Франсиско Хавиер Клавиеро (1731-1787), важен и уважаван йезуит в историята на идеите, предшественик на нашата зависимост, инициатор и екзалтер на нашето силно местно културно наследство, реформатор на съвременната философия на Мексико и на преподаването на науката, поради нейното „разбиране на родината като реалност, различна от Испания“ и заради нейния постоянен и чувствителен урок по любов към това, което е наше.
Клавиеро вече е бил в Пуебла и преди години в Сан Херонимо, Сан Игнасио, Е. И. Еспириту Санто и Сан Илдефонсо, определящи фактори в неговото хуманистично обучение. Той се завръща в Сан Хавиер, след като открива прекрасното наследство, което Карлос де Сигуенца и Гонгора е оставил в Колегио де Сан Пабло де ла Виея Мексико-Теночтитлан, със сигурност привлечен от местното величие, културните корени на Мексико. Предполага се, че този йезуит е научил Нахуатл в Сан Хавиер, което ще му позволи да напише своята основна Древна история на Мексико в изгнание.
Несъмнено престоят му в Пуебла допринесе за изковаването на тази забележителна личност, която от Ангелополис премина във Валядолид (Морелия), където по-късно неговите учения повлияха върху формирането на национални фигури като Мигел Идалго и Костила.
Църквата Сан Хавиер, построена през осемнадесети век, е била една от най-красивите сгради от игнатийския орден в Пуебла, нейната украса е с всякакъв вкус, нейният арогантен купол има една кула, красивите изображения на фасадата на три тела на причудлив доричен, казва Марко Диас. Аркадите и вътрешният двор са преобразени анархично през 1949 г., оставяйки само страничен вход с интересни форми.
В апсидата имаше позлатен олтар с изящна и изящна изработка, в центъра на който беше поставен под красив павилион със същия размер красив образ на Свети Франциск Ксавие. Според д-р Ефраин Кастро авторите на този олтар са същите, които са направили този в Тепозотлан: Мигел Кабрера и Хигинио де Чавес.
Храмът е изоставен с изгонването на йезуитите през 1767 г .; 28 години по-късно, през 1795 г., се говори за голямото му влошаване и на следващата година Антонио де Санта Мария Инчауреги коментира ремонта му. В момента крайната дестинация на нейните артистични богатства е неизвестна, като например олтарите с фигурите на светите Хосе и Игнасио и забележителни гватемалски парчета. На корицата на Сан Хавиер, при почистване на камъните му, ударите от шрапнели, получени на площадката в Пуебла през 1863 г., се очертават като неми свидетели.
По силата на закон, издаден от Конгреса на Съюза, на 13 януари 1834 г. Сан Хавиер става собственост на правителството на щата Пуебла и именно тогава е построен новият държавен затвор до храма и колежа в съответствие с с плановете на великия архитект и реновист на Пуебла Хосе Манцо (1787-1860), по начина на затвора в Синсинати. Този много напреднал по своето време проект включваше семинари за рехабилитация на затворници, които ги поддържаха активни и осигуряваха средства за подкрепа на техните семейства.
Първоначалната заслуга на тази работа съответства на генерал Фелипе Кодалос, управител на щата между 1837-1841 г., който положи първия камък на 11 декември 1840 г. Напредъкът в строителството беше забележителен до 1847 г., когато беше прекъснат и сериозно засегнат от разума на американската намеса. През 1849 г., с губернатора Хуан Мухика и Осорио, строителството е подновено, но нова намеса, вече френска, спира строителството отново.
След възвишената победа на 5 май 1862 г. и заемането му като казарма, Poblano Joaquín Colombres превръща пенитенциарното заведение във Форт Итурбиде за отбраната на града, превръщайки се в героичното място от 1863 г. Сан Хавиер, заради Отчасти от 18 до 29 март същата година беше много важен бастион, където мексиканските войски написаха един от най-добрите си епоси, въпреки че сградата беше почти напълно разрушена от бомбардировките.
Година по-късно, през 1864 г., силно земетресение значително уврежда комплекса на затвора и сградата на Сан Хавиер, от която пада единствената му кула.
На 13 декември 1879 г. група пуеблани пое задачата да продължи и завърши голямата работа, образувайки комитет за възстановяване, който генерал Хуан Кристостомо Бонила (губернатор от 1878 до 1880 г.) спонсорира с указ на Държавния конгрес. Работите започват на 5 февруари 1880 г. под ръководството на архитекта от Пуебла Едуардо Тамарис и Хуан Калва и Замудио, които спазват първоначалните насоки на Хосе Манцо.
С по-късните управители на образуванието (генерали Хуан Н. Мендес, управлявал през 1880 г., и Росендо Маркес, който го е правил между 1881 и 1892 г.), е приключила безкрайната работа. Реконструкцията беше почти завършена: мъжки и женски апартаменти, трезори, стълби, офиси, 36 павилиона и половин хиляда килии.
На 1 април 1891 г. смъртното наказание е премахнато в държавата - първо в страната -, Съветът за защита на затворниците е създаден и са направени различни реформи в Наказателния кодекс на субекта и на следващия ден Порфирио Диас, президент на Републиката пусна в изпълнение Пенитенциарното заведение.
По отношение на разходите за неговото изграждане, заслужава да се споменат следните данни: през 1840 г. е установен специален принос от 2,5% върху продажбата на ликьори, а през 1848 г. на пулкериите е определена квота от 2 reales se manarios, " данъци “, които никога не са били достатъчни за голямата работа. От 1847 до 1863 г. са инвестирани 119 540,42 песо, а от 1880 до 1891 г. са похарчени 182 085,14.
Общините покривали ежемесечно издръжката на затворниците, идващи от техния регион. Годишните разходи на Пенитенциарното заведение през първите години са над 40 хиляди песо. През 1903 г. лекарите Грегорио Вергара и Франсиско Мартинес Бака създават антропометрична и криминалистична лаборатория в институцията, както и музей с над 60 черепа на затворници, починали в затвора, понастоящем под надзора на INAH.
Сградата на Сан Хавиер имаше различни цели: казарми, склад, военна болница, болница за епидемии, пожарна, общинска електрическа служба и трапезария на Пенитенциарното заведение, за което постепенно беше разрушена. През 1948 г. в двора и аркадите на Сан Хавиер е инсталирано държавно училище, което сериозно уврежда архитектурния комплекс, а през 1973 г. и последните години неговите сводове са сериозно засегнати.
Пенитенциарното заведение в Пуебла функционира до 1984 г., годината, през която губернаторът на щата Гилермо Хименес Моралес провежда популярна консултация, за да остави решението за използването и предназначението на тези исторически сгради в ръцете на хората в Пуебла, в една от които блести талантът на Франсиско Хавиер Клавиеро, нашите местни езици бяха разпространени и беше извършена важна образователна работа, в допълнение към странната защита на националната цялост и в двата случая, поне на два пъти. Единодушно побланосът поиска от изпълнителния директор да преустрои пенитенциарното заведение и да спаси Сан Хавиер, за да ги посвети на културни дейности и като богати свидетелства, необходими за поддържането на живата историческа памет на Пуебла.
